أقر المجلس الأعلى للأزهر في جلسته رقم (234) القواعد الجديدة المنظمة للمرحلة الابتدائية بالمعاهد الأزهرية، وهي كالتالي:
1- أن يكون النقل في الصف الأول الابتدائي تلقائيًا للصف الثاني الابتدائي.
2- أن يكون النقل في الصف الثانى الابتدائي للصف الثالث الابتدائي بعد الامتحان فى الفصلين الدراسيين، فإذا رسب ينقل تلقائيًا، ويعمل له برنامج تأهيلي وفق القواعد التي عرضت من قطاع المعاهد الأزهرية.
3- بالنسبة للصف الثالث الابتدائي:
أ- ينقل الطالب إلى الصف الأعلى إذا حصل على درجة النجاح فى كل مادة على حدة، بشرط حصوله على 50% من النهاية العظمى في الفصلين الدراسيين في المواد الآتية: {القرآن الكريم شفويا 12.5 درجة ، تحريريا 37.5} ، {التربية الإسلامية – اللغة العربية – الرياضيات – اللغة الإنجليزية} تحريريًا.
ب- الطالب الذي يرسب في مادة أو أكثر من المواد المقررة، له الحق في دخول امتحان الدور الثاني الذي يعقد في نهاية العام الدراسي، فإذا نجح في المواد التي دخل فيها الامتحان ولم يتخلف عن أي مادة ينقل للصف الذي يليه.
ج- إذا رسب الطالب في إحدى المواد الآتية: {القرآن الكريم – التربية الإسلامية – اللغة العربية – الرياضيات – اللغة الإنجليزية} يعيد العام الدراسي في الصف الذي رسب فيه.